Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VimP20152 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VimP20152 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VimP20152 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VimP20152 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VimP20152 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VimP20152 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VimP20152 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VimP20152 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VimP20152 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VimP20152 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VimP20152 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VimP20152 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VimP20152 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VimP20152 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VimP20152 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VimP20152 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VimP20152 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VimP20152 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VimP20152 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VimP20152 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VimP20152 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VimP20152 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VimP20152 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VimP20152 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VimP20152 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VimP20152 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms