Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DSPP15924 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSPP15924 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSPP15924 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSPP15924 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSPP15924 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSPP15924 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSPP15924 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSPP15924 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DSPP15924 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
DSPP15924 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DSPP15924 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSPP15924 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSPP15924 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSPP15924 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSPP15924 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DSPP15924 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSPP15924 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSPP15924 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSPP15924 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSPP15924 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSPP15924 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DSPP15924 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSPP15924 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSPP15924 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSPP15924 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSPP15924 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DSPP15924 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSPP15924 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DSPP15924 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms