Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irf1P15314 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf1P15314 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf1P15314 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf1P15314 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irf1P15314 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Irf1P15314 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf1P15314 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irf1P15314 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irf1P15314 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irf1P15314 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irf1P15314 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf1P15314 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf1P15314 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Irf1P15314 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irf1P15314 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Irf1P15314 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irf1P15314 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irf1P15314 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Irf1P15314 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irf1P15314 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irf1P15314 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irf1P15314 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irf1P15314 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Irf1P15314 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms