Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Tnp1P10856 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms