Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefmP08553 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefmP08553 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NefmP08553 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefmP08553 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NefmP08553 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NefmP08553 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NefmP08553 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NefmP08553 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NefmP08553 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NefmP08553 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NefmP08553 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NefmP08553 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefmP08553 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefmP08553 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefmP08553 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefmP08553 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefmP08553 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefmP08553 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefmP08553 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefmP08553 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NefmP08553 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NefmP08553 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefmP08553 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefmP08553 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefmP08553 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefmP08553 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NefmP08553 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefmP08553 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefmP08553 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NefmP08553 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NefmP08553 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NefmP08553 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NefmP08553 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NefmP08553 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NefmP08553 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NefmP08553 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NefmP08553 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NefmP08553 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NefmP08553 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NefmP08553 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NefmP08553 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NefmP08553 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NefmP08553 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NefmP08553 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NefmP08553 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NefmP08553 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NefmP08553 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NefmP08553 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NefmP08553 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NefmP08553 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NefmP08553 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NefmP08553 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NefmP08553 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NefmP08553 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NefmP08553 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NefmP08553 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NefmP08553 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms