Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Col4a2P08122 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a2P08122 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a2P08122 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a2P08122 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col4a2P08122 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a2P08122 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a2P08122 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a2P08122 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a2P08122 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a2P08122 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Col4a2P08122 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a2P08122 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a2P08122 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a2P08122 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a2P08122 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a2P08122 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a2P08122 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Col4a2P08122 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a2P08122 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a2P08122 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a2P08122 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col4a2P08122 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a2P08122 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a2P08122 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Col4a2P08122 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Col4a2P08122 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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