Protein–RNA interactions for Protein: P06329

Ig heavy chain V region AC38 15.3, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06329 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06329 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06329 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06329 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06329 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06329 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P06329 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06329 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06329 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms