Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRB1P04280 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRB1P04280 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRB1P04280 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRB1P04280 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRB1P04280 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRB1P04280 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRB1P04280 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRB1P04280 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRB1P04280 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRB1P04280 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRB1P04280 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRB1P04280 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRB1P04280 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRB1P04280 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRB1P04280 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRB1P04280 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRB1P04280 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRB1P04280 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRB1P04280 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRB1P04280 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRB1P04280 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRB1P04280 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRB1P04280 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRB1P04280 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRB1P04280 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRB1P04280 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRB1P04280 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRB1P04280 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRB1P04280 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRB1P04280 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRB1P04280 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRB1P04280 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRB1P04280 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRB1P04280 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PRB1P04280 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRB1P04280 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PRB1P04280 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms