Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-AaP01910 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-AaP01910 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms