Protein–RNA interactions for Protein: P01635

Ig kappa chain V-V region K2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01635 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01635 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01635 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01635 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01635 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01635 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01635 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01635 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01635 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
P01635 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01635 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P01635 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01635 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01635 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01635 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01635 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms