Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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F11rO88792 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
F11rO88792 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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F11rO88792 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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F11rO88792 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
F11rO88792 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
F11rO88792 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
F11rO88792 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
F11rO88792 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
F11rO88792 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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F11rO88792 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F11rO88792 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F11rO88792 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F11rO88792 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
F11rO88792 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F11rO88792 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F11rO88792 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F11rO88792 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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F11rO88792 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F11rO88792 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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F11rO88792 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F11rO88792 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F11rO88792 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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F11rO88792 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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F11rO88792 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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F11rO88792 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
F11rO88792 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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F11rO88792 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F11rO88792 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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F11rO88792 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F11rO88792 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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F11rO88792 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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F11rO88792 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
F11rO88792 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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F11rO88792 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F11rO88792 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
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F11rO88792 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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F11rO88792 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F11rO88792 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
F11rO88792 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F11rO88792 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F11rO88792 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F11rO88792 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
F11rO88792 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F11rO88792 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F11rO88792 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
F11rO88792 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
F11rO88792 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
F11rO88792 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms