Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp4O70480 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms