Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd2O35927 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd2O35927 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd2O35927 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd2O35927 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd2O35927 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd2O35927 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd2O35927 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd2O35927 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd2O35927 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd2O35927 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ctnnd2O35927 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnnd2O35927 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms