Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Opn1mwO35599 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Opn1mwO35599 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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Opn1mwO35599 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Opn1mwO35599 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Opn1mwO35599 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Opn1mwO35599 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Opn1mwO35599 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms