Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ArxO35085 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ArxO35085 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ArxO35085 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ArxO35085 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ArxO35085 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ArxO35085 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ArxO35085 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ArxO35085 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ArxO35085 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ArxO35085 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ArxO35085 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ArxO35085 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ArxO35085 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ArxO35085 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ArxO35085 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ArxO35085 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ArxO35085 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ArxO35085 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ArxO35085 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ArxO35085 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ArxO35085 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ArxO35085 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ArxO35085 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ArxO35085 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ArxO35085 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ArxO35085 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ArxO35085 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ArxO35085 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ArxO35085 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ArxO35085 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ArxO35085 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ArxO35085 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ArxO35085 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ArxO35085 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ArxO35085 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ArxO35085 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ArxO35085 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ArxO35085 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ArxO35085 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ArxO35085 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ArxO35085 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ArxO35085 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ArxO35085 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ArxO35085 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ArxO35085 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ArxO35085 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ArxO35085 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ArxO35085 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ArxO35085 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ArxO35085 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ArxO35085 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ArxO35085 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ArxO35085 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ArxO35085 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ArxO35085 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms