Protein–RNA interactions for Protein: O08852

Pkd1, Polycystin-1, mousemouse

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Length 4,293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1O08852 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Pkd1O08852 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Pkd1O08852 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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