Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna5O08543 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efna5O08543 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efna5O08543 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efna5O08543 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efna5O08543 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efna5O08543 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efna5O08543 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Efna5O08543 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efna5O08543 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efna5O08543 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Efna5O08543 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efna5O08543 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efna5O08543 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efna5O08543 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efna5O08543 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms