Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU0

Spin2f, Spindlin family, member 2F, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spin2fJ3QPU0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spin2fJ3QPU0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spin2fJ3QPU0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spin2fJ3QPU0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Spin2fJ3QPU0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spin2fJ3QPU0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms