Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm20795J3QP49 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm20795J3QP49 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm20795J3QP49 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm20795J3QP49 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm20795J3QP49 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm20795J3QP49 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm20795J3QP49 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm20795J3QP49 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Gm20795J3QP49 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm20795J3QP49 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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