Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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