Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21411J3KMS0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21411J3KMS0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms