Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atf6F6VAN0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atf6F6VAN0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms