Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28305F6U473 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28305F6U473 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28305F6U473 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28305F6U473 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28305F6U473 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28305F6U473 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28305F6U473 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28305F6U473 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28305F6U473 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28305F6U473 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm28305F6U473 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm28305F6U473 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm28305F6U473 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm28305F6U473 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm28305F6U473 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm28305F6U473 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm28305F6U473 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm28305F6U473 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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