Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm340F6RGI3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms