Protein–RNA interactions for Protein: E9PWI3

Mcc, Mutated in colorectal cancers, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MccE9PWI3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
MccE9PWI3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MccE9PWI3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms