Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc175E9PVB3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc175E9PVB3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms