Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc8D3YZV8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms