Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim30cD3YVI9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms