Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usf3B2RUQ2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms