Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssxb8B1AY40 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms