Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PSDA5PKW4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSDA5PKW4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms