Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
4930447F04RikA2AFR2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
4930447F04RikA2AFR2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms