Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sppl2cA2A6C4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sppl2cA2A6C4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms