Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pkd2l1A2A259 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pkd2l1A2A259 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms