Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQI7

B020011L13Rik, RIKEN cDNA B020011L13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B020011L13RikA0A087WQI7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
B020011L13RikA0A087WQI7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
B020011L13RikA0A087WQI7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms