Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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LHX9Q9NQ69 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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LHX9Q9NQ69 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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LHX9Q9NQ69 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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