Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
ARXQ96QS3 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms