Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
TRERF1Q96PN7 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRERF1Q96PN7 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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