Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
ZBED3Q96IU2 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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