Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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GEN1Q17RS7 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
GEN1Q17RS7 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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