Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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CDO1Q16878 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CDO1Q16878 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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CDO1Q16878 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
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CDO1Q16878 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
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CDO1Q16878 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
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CDO1Q16878 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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CDO1Q16878 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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CDO1Q16878 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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CDO1Q16878 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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CDO1Q16878 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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CDO1Q16878 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CDO1Q16878 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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