Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SSX1Q16384 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms