Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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SIX1Q15475 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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SIX1Q15475 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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SIX1Q15475 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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SIX1Q15475 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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SIX1Q15475 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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SIX1Q15475 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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SIX1Q15475 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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SIX1Q15475 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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SIX1Q15475 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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SIX1Q15475 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SIX1Q15475 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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