Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ITGA9Q13797 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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ITGA9Q13797 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ITGA9Q13797 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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