Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
SP140Q13342 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SP140Q13342 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SP140Q13342 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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