Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
IFT88Q13099 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms