Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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TRAF1Q13077 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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TRAF1Q13077 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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TRAF1Q13077 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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TRAF1Q13077 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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TRAF1Q13077 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
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TRAF1Q13077 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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TRAF1Q13077 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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TRAF1Q13077 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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TRAF1Q13077 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
TRAF1Q13077 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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