Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
GRIK2Q13002 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms