Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
PTP4A2Q12974 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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PTP4A2Q12974 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PTP4A2Q12974 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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