Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TROQ12816 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROQ12816 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROQ12816 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TROQ12816 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TROQ12816 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROQ12816 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROQ12816 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TROQ12816 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TROQ12816 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROQ12816 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TROQ12816 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TROQ12816 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TROQ12816 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROQ12816 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROQ12816 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROQ12816 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TROQ12816 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TROQ12816 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TROQ12816 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TROQ12816 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TROQ12816 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TROQ12816 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TROQ12816 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TROQ12816 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TROQ12816 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TROQ12816 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TROQ12816 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TROQ12816 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TROQ12816 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TROQ12816 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TROQ12816 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TROQ12816 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TROQ12816 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TROQ12816 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TROQ12816 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TROQ12816 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TROQ12816 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
TROQ12816 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TROQ12816 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TROQ12816 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TROQ12816 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
TROQ12816 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TROQ12816 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
TROQ12816 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TROQ12816 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TROQ12816 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TROQ12816 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TROQ12816 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TROQ12816 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TROQ12816 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TROQ12816 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TROQ12816 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TROQ12816 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TROQ12816 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TROQ12816 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
TROQ12816 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TROQ12816 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TROQ12816 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TROQ12816 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TROQ12816 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TROQ12816 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TROQ12816 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TROQ12816 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TROQ12816 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TROQ12816 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TROQ12816 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
TROQ12816 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TROQ12816 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TROQ12816 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TROQ12816 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TROQ12816 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TROQ12816 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TROQ12816 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TROQ12816 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
TROQ12816 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TROQ12816 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TROQ12816 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TROQ12816 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
TROQ12816 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms